工程保函是指按照保函申请人的申请，依据工程合同开出的，但又不依附于工程合同，是具有独立法律效力的法律文件。当保函受益人在保函项下合理索赔时，保函出具人就必须承担付款责任，而不论保函申请人是否同意付款，也不管合同履行的实际事实，即保函是独立的承诺。
工程保函按照出具方的不同分为银行保函和担保公司保函，一般以银行保函为主。
工程保函担保顾名思义就是指担保公司为保函申请人向银行申请工程保函提供担保，当申请人无力履行责任时，担保公司作为担保人承担连带担保责任。
工程项目属于资金密集型的投资，项目建设周期较长，资金需求量较大，工程项目往往未完全取得相关施工批文，就要求承包商进场，前期资金投入较大。过往以保证金的方式进行履约担保，不仅给承包商造成较大的资金压力，增加项目的资金成本，影响了承包商的施工进度，也给发包商带来了相对繁琐的保证金管理。
工程保函的出现，较好地解决了工程项目中的资金问题，减少承包商的沉默资金，缓解承包商的资金压力，提高了承包商自有资金的利用效率，降低了项目的资金成本，为顺利完工提供了有力的资金支持。同时，承包商用保函替代保证金，免去了发包商繁琐的保证金管理手续。
工程保函有哪些常用种类？
1、投标保函：即招投标过程中要求投标人提供银行出具的保函，以担保投标材料真实、中标后不会因不正当理由不订立合同。担保金额一般为招标价的3%。
2、预付款保函：即担保预付款会按照合同要求使用。通常施工企业提供一张预付款保函给业主(开发商、保函受益人)，业主即拨付同等金额的预付款给施工企业。担保金额一般为合同价的10%-30%。
3、履约保函：即担保企业签订施工合同后，能按合同履约。担保金额一般为中标价或者合同价的10%-30%。
4、农民工工资支付保函：即担保业主或者施工企业不拖欠农民工工资。通常受益人是工程所在地社保局或者劳动局或者建设局。
5、质量保函：即工程竣工验收之后，担保工程质量不出问题。通常质量保函的期限是两年，担保金额为合同价的3%-10%。
【法律依据】;
《人民法院关于审理独立保函纠纷案件若干问题的规定》
第三条 保函具有下列情形之一，当事人主张保函性质为独立保函的，人民法院应予支持，但保函未载明据以付款的单据和金额的除外：
(一)保函载明见索即付；
(二)保函载明适用国际商会《见索即付保函统一规则》等独立保函交易示范规则；
(三)根据保函文本内容，开立人的付款义务独立于基础交易关系及保函申请法律关系，其仅承担相符交单的付款责任。